Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEMP2A6NFY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEMP2A6NFY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms