Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FITM1A5D6W6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FITM1A5D6W6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FITM1A5D6W6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FITM1A5D6W6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms