Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC144AA2RUR9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC144AA2RUR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
CCDC144AA2RUR9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC144AA2RUR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms