Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LNP1A1A4G5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LNP1A1A4G5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LNP1A1A4G5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms