Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A8A0AV02 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A8A0AV02 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms