Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0U1RRA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0U1RRA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0U1RRA0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms