Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXX1

IGHV5-10-1, Immunoglobulin heavy variable 5-10-1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms