Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CYTH4Q9UIA0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms