Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms