Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms