Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms