Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C9orf85Q96MD7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms