Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FAM13A-207ENST00000504836 2287 ntTSL 29.53□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 58.96□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 ARG2-203ENST00000557120 836 ntTSL 28.85□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 HEXA-213ENST00000568777 6909 ntTSL 58.72□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 STRN3-205ENST00000554991 417 ntTSL 58.39□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 FAM193B-206ENST00000506432 426 ntTSL 28.29□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 58.26□□□□□ -1.092e-11■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 RNF19A-210ENST00000522369 612 ntTSL 48.19□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 ARG2-202ENST00000556491 457 ntTSL 55.87□□□□□ -1.473e-7■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 BRD4-209ENST00000601071 430 ntTSL 55.57□□□□□ -1.522e-11■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 SHANK2-216ENST00000482659 381 ntTSL 34.52□□□□□ -1.694e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.834e-6■■■■■ 29.4
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TBRG4Q969Z0 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 29.4
TBRG4Q969Z0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 29.3
TBRG4Q969Z0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 29.3
TBRG4Q969Z0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 29.3
TBRG4Q969Z0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 29.3
TBRG4Q969Z0 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 29.3
TBRG4Q969Z0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-12■■■■■ 29.2
TBRG4Q969Z0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-12■■■■■ 29.2
TBRG4Q969Z0 MED29-205ENST00000599417 2941 ntTSL 213.64□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 29.2
TBRG4Q969Z0 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-12■■■■■ 29.2
TBRG4Q969Z0 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-12■■■■■ 29.2
TBRG4Q969Z0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.245e-7■■■■■ 29.2
TBRG4Q969Z0 SHANK2-207ENST00000425049 557 ntTSL 416.19■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 29.2
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TBRG4Q969Z0 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 29.1
TBRG4Q969Z0 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 29.1
TBRG4Q969Z0 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 29.1
TBRG4Q969Z0 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 515.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 29.1
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TBRG4Q969Z0 FILIP1L-210ENST00000495625 2898 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.526e-6■■■■■ 29
TBRG4Q969Z0 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.46e-6■■■■■ 29
TBRG4Q969Z0 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.436e-6■■■■■ 29
TBRG4Q969Z0 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.916e-6■■■■■ 29
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TBRG4Q969Z0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 29
TBRG4Q969Z0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 29
TBRG4Q969Z0 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 28.24□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 28.9
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TBRG4Q969Z0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 28.8
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TBRG4Q969Z0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 28.8
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TBRG4Q969Z0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 TESC-207ENST00000549210 422 ntTSL 218.44■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 PPP4R3A-203ENST00000554511 580 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 317.47■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 H2AFY2-202ENST00000455786 908 ntTSL 517.41■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 517.31■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 PPP4R3A-202ENST00000554390 2953 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 RBM33-210ENST00000486747 559 ntTSL 316.61■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 216.55■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 PPP4R3A-211ENST00000557018 534 ntTSL 516.52■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 216.52■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 215.53■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 ENO3-215ENST00000522798 563 ntTSL 315.51■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 28.8
TBRG4Q969Z0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 28.8
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