Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD12Q8N8I0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms