Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCSAMQ8N6F7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GCSAMQ8N6F7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms