Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUSD1Q6UWL2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms