Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK4Q16654 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK4Q16654 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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