Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLFQ16534 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLFQ16534 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLFQ16534 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLFQ16534 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLFQ16534 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms