Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD1Q15327 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD1Q15327 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD1Q15327 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD1Q15327 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD1Q15327 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD1Q15327 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD1Q15327 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms