Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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