Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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