Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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BNIP1Q12981 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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