Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OCA2Q04671 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OCA2Q04671 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms