Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS28P62857 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms