Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 323.41■■□□□ 1.347e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 522.43■■□□□ 1.187e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 421.79■■□□□ 1.087e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 419.39■□□□□ 0.697e-7■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 412.13□□□□□ -0.477e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.497e-7■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 UBE2D3-227ENST00000508818 584 ntTSL 211.3□□□□□ -0.67e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.697e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-223ENST00000508249 604 ntTSL 410.73□□□□□ -0.697e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.937e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBE2D3-222ENST00000508238 547 ntTSL 48.84□□□□□ -0.997e-7■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 UBL5-203ENST00000588141 573 ntTSL 422.71■■□□□ 1.239e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.079e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.989e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 320.27■□□□□ 0.849e-10■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.29e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 KLHL22-202ENST00000423364 769 ntTSL 313.34□□□□□ -0.279e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 AC104041.1-202ENST00000560097 566 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.39e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SEPT8-213ENST00000481030 790 ntTSL 313.15□□□□□ -0.35e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.469e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 AC104041.1-201ENST00000560054 569 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.679e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.719e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.539e-10■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.655e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.525e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.353e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 EFCAB2-213ENST00000497591 1201 ntTSL 513.3□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 EFCAB2-211ENST00000487845 1389 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 EFCAB2-204ENST00000391837 738 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-6■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.117e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-205ENST00000578574 958 ntTSL 226.62■■□□□ 1.857e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-220ENST00000584781 562 ntTSL 425.42■■□□□ 1.667e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.237e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-208ENST00000579572 863 ntTSL 322.24■■□□□ 1.157e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-219ENST00000584689 1033 ntTSL 220.94■□□□□ 0.947e-8■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 SLC16A3-206ENST00000578684 866 ntTSL 320.71■□□□□ 0.917e-8■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 517.48■□□□□ 0.397e-8■■■□□ 15.7
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GTF2F1P35269 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.744e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.734e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.584e-7■■■□□ 15.7
GTF2F1P35269 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.793e-10■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 COL4A3BP-202ENST00000357457 886 ntTSL 59.86□□□□□ -0.833e-10■■■□□ 15.6
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GTF2F1P35269 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 224.64■■□□□ 1.538e-23■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.338e-23■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.088e-23■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 CERS4-216ENST00000600912 440 ntTSL 320.83■□□□□ 0.939e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 512.12□□□□□ -0.474e-14■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 318.71■□□□□ 0.593e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.71e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 CX3CL1-202ENST00000563383 3313 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.962e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.652e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 523.93■■□□□ 1.422e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.052e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 218.94■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.13■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RRP36-201ENST00000244496 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 RRP36-202ENST00000607394 528 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-7■■■□□ 15.6
GTF2F1P35269 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.947e-13■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.757e-13■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 413.02□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.328e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.248e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.018e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-207ENST00000443704 1783 ntTSL 519.57■□□□□ 0.728e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.588e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.558e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-208ENST00000455657 907 ntTSL 518.36■□□□□ 0.538e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-210ENST00000480506 835 ntTSL 513.69□□□□□ -0.228e-10■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 GMPPA-206ENST00000435316 786 ntTSL 512.02□□□□□ -0.498e-10■■■□□ 15.5
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