Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms