Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
IFITM1P13164 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms