Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB2P05107 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms