Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24BO95487 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24BO95487 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24BO95487 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms