Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSTPIP1O43586 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms