Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC01558Q9Y6Z2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms