Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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