Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms