Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF501Q96CX3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms