Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms