Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RNF148Q8N7C7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RNF148Q8N7C7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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RNF148Q8N7C7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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RNF148Q8N7C7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF148Q8N7C7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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