Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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