Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LDLRAP1Q5SW96 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms