Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms