Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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