Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXF2Q12947 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXF2Q12947 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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