Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4CQ08493 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE4CQ08493 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms