Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AIF1P55008 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AIF1P55008 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms