Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPGP40121 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPGP40121 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPGP40121 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms