Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IGHG1P01857 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms