Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms