Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms