Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUOX2Q9NRD8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms