Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms