Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms